龍神の骨（りゅうじんのほね）は、天返宮の第二百層で戦えるボスから入手できました（以下の画像参照）。
龍神の骨は天返宮（第二百層のボス）で入手
龍神の骨は、天返宮の第二百層で戦えるボスを倒した報酬として入手できました。
上記の画像は、第二百層で龍神の骨を入手した際のものです。どの階層のボスから固定で入手できる、というわけではなく、ランダムで入手できるものだと考えられます。
第百層のボスから入手できるかどうかは未検証です。
龍神の骨の集め方
これは、龍神の骨が天返宮の第二百層の各ボスからランダムで入手できる場合になります。
龍神の骨を効率良く集めるには、第二百五層の『豚鬼大将』と戦う前にセーブしておき、討伐して龍神の骨が入手できなかったらロードして再戦する、という方法が良いかなと個人的に考えています。第二百層の中でおそらく一番弱く、倒しやすいからです。
ただ、より効率の良い方法があるかも知れません。それらが判明したら追記します。